1.   COVID-19疫情快訊

■3月4日，國家衛(wèi)生健康委、國家中醫(yī)藥管理局組織專家在對前期醫(yī)療救治工作進(jìn)行分析研判總結(jié)的基礎(chǔ)上，對診療方案進(jìn)行再次修訂，形成了《新冠肺炎診療方案（試行第七版）》。這次修訂增加了病理改變內(nèi)容，對臨床表現(xiàn)、診斷標(biāo)準(zhǔn)、治療方法和出院標(biāo)準(zhǔn)等也進(jìn)行了增補(bǔ)和調(diào)整，將有利于根據(jù)不同人群的疾病特點(diǎn)，更加精準(zhǔn)的開展診療和救治。其中，傳播途徑方面增加“由于在糞便及尿中可分離到新型冠狀病毒，應(yīng)注意糞便及尿?qū)Νh(huán)境污染造成氣溶膠或接觸傳播”。另外，鑒于有少數(shù)出院患者出現(xiàn)核酸檢測復(fù)檢陽性的問題，為加強(qiáng)對出院患者的健康管理和隔離，此次修訂將“應(yīng)繼續(xù)進(jìn)行14天自我健康狀況監(jiān)測”改為“應(yīng)繼續(xù)進(jìn)行14天的隔離管理和健康狀況監(jiān)測”，同時要求佩戴口罩，有條件的居住在通風(fēng)良好的單人房間，減少與家人的近距離密切接觸，分餐飲食，做好手衛(wèi)生，避免外出活動。

■3月2日，芝加哥大學(xué)官網(wǎng)發(fā)布消息稱，由芝加哥大學(xué)、阿貢國家實(shí)驗(yàn)室等團(tuán)隊(duì)聯(lián)合研究，在2019-nCoV蛋白中發(fā)現(xiàn)了COVID-19新的潛在的藥物靶點(diǎn)。該靶點(diǎn)Nsp15蛋白與SARS爆發(fā)時期的蛋白有89%的氨基酸序列同源性，而關(guān)于SARS病毒的研究表明,抑制該靶點(diǎn)可以減緩病毒的復(fù)制，這意味著針對Nsp15的藥物可以作為治療COVID-19的潛在藥物。新定位的蛋白Nsp15，在冠狀病毒中具有保守性，在它們的生命周期和毒力中都是必不可少的。最初，Nsp15被認(rèn)為是直接參與病毒復(fù)制，但在本次研究中，研究人員發(fā)現(xiàn)，Nsp15通過干擾宿主的免疫反應(yīng)來幫助病毒復(fù)制。Nsp15蛋白在SARS中被作為新藥開發(fā)的新靶點(diǎn)，但并未取得很大進(jìn)展，因?yàn)镾ARS疫情消失后，所有的新藥研發(fā)都結(jié)束了。一些抑制劑雖然在當(dāng)時已經(jīng)被鑒定了出來，但從未進(jìn)一步進(jìn)行藥物研發(fā)，針對SARS開發(fā)的抑制劑現(xiàn)在可以針對這種蛋白進(jìn)行測試。另外，Nsp15的結(jié)構(gòu)將于3月4日在RSCB蛋白數(shù)據(jù)庫上發(fā)布。

（參見：https://news.uchicago.edu/story/new-coronavirus-protein-mapped-chicago-reveals-drug-target）

2. COVID-19生物學(xué)研究進(jìn)展 

■3月3日，北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心陸劍研究員和中國科學(xué)院上海巴斯德研究所崔杰研究員在中國科學(xué)院主辦的National Science Review上發(fā)表了名為《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》（On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）的論文。論文通過對103個新冠病毒全基因組分子進(jìn)化分析，發(fā)現(xiàn)病毒株已發(fā)生了149個突變點(diǎn)，而且多數(shù)是近期產(chǎn)生的。該研究揭示：新冠病毒已經(jīng)演化出L和S兩個亞型，其中101個屬于這兩個亞型。從占比上看，L亞型更為普遍達(dá)到70%，S亞型占30%。論文作者認(rèn)為，根據(jù)新型冠狀病毒的演變方式推測，L亞型和S亞型的傳播能力、致病嚴(yán)重程度或許存在較大區(qū)別。通過與其他冠狀病毒比較，作者發(fā)現(xiàn)S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進(jìn)化樹上更接近，從而得出S型相對更古老的結(jié)論。L亞型在武漢爆發(fā)的早期階段更為普遍，而L亞型的發(fā)生頻率在2020年1月初后有所下降。作者認(rèn)為，人為干預(yù)可能對L亞型施加了更大的選擇性壓力，如果沒有這些干預(yù)，L亞型可能更具侵略性和擴(kuò)散得更快速。另一方面，由于選擇壓力相對較弱，在進(jìn)化上較老且攻擊性較小的S型可能在相對發(fā)生頻率上有所增加。這些發(fā)現(xiàn)意味著，目前迫切需要結(jié)合基因組數(shù)據(jù)、流行病學(xué)數(shù)據(jù)和2019年冠狀病毒病患者臨床癥狀圖表記錄，進(jìn)行進(jìn)一步的全面研究。另外，值得注意的是，這103個樣本顯示，大部分患者只感染了L亞型或S亞型中的一個。但其中一位近期有過武漢旅行史的美國患者分離出的病毒株，顯示其可能同時感染了L型和S型新冠病毒。不過，作者表示目前還無法排除新突變型的可能性[1]。
■3月2日，來自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院等單位的科研人員在預(yù)印本平臺bioRxiv上發(fā)表了一篇題為“新冠病毒演化中的突變、重組與插入”（Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV）的研究。研究團(tuán)隊(duì)收集并分析了120個新冠病毒基因組序列，其中包括從11名中國患者身上最新采集到的毒株基因組序列。研究構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明，不同毒株之間基因序列的差異非常有限。擁有3萬堿基的新冠病毒，只有幾個堿基發(fā)生了變異。
研究還認(rèn)為，與新冠病毒同源性最高的蝙蝠RaTG13病毒和穿山甲冠狀病毒之間可能發(fā)生過基因重組。因此，盡管新冠病毒在整體基因結(jié)構(gòu)上與RaTG13最高度同源，但其表面的S蛋白與受體結(jié)合的結(jié)構(gòu)域與穿山甲冠狀病毒最一致。而S蛋白中存在的獨(dú)特的四個氨基酸插入（PRRA），可能是弗林（Furin）蛋白酶或TMPRSS2（跨膜絲氨酸蛋白酶2）的酶切位點(diǎn)。冠狀病毒在入侵宿主細(xì)胞時有可能發(fā)生了蛋白酶裂解，從而觸發(fā)病毒與宿主細(xì)胞膜的融合。以上可能解釋新冠病毒的傳染性為何會如此之強(qiáng)[2]。

3. COVID-19流行病學(xué)研究 

■3月4日，新加坡國家傳染病中心的研究者在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊JAMA在線發(fā)表題為“Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient”的研究論文，該研究從新加坡3名患者在空氣傳播隔離室（每小時進(jìn)行12次空氣交換）、休息室和浴室等26個地點(diǎn)采集了地面環(huán)境樣本。該研究發(fā)現(xiàn)，一名患者的樣本在15個房間（包括排氣扇）中有13個（87％）檢測結(jié)果呈陽性，在5個廁所（馬桶、水槽和門把手）中有3個（60％）結(jié)果呈陽性。另外，患者的大便樣本檢測呈現(xiàn)陽性。

該研究顯示，一名輕度上呼吸道感染的2019-nCoV患者對環(huán)境造成了廣泛的污染：馬桶和水槽樣本均為陽性，表明糞便中的病毒可能是潛在的傳播途徑。清潔后樣品為陰性，表明目前的清潔措施已足夠。從排氣口抽出的拭子測試呈陽性，表明載有病毒的細(xì)小顆?？赡鼙粴饬髦脫Q并沉積在通風(fēng)口等設(shè)備上。2019-nCoV患者通過呼吸道飛沫和排出的糞便對環(huán)境造成污染，表明環(huán)境是潛在的傳播媒介，因此有必要嚴(yán)格遵守環(huán)境衛(wèi)生和手部衛(wèi)生[3]。

■3月3日，新加坡國家傳染病中心的研究者們在頂級醫(yī)學(xué)期刊JAMA在線發(fā)表題為“Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore”的研究論文，該研究首次介紹了新加坡2019-nCoV感染患者的流行病學(xué)特征和臨床過程。該研究發(fā)現(xiàn)，在18例經(jīng)PCR確診的2019-nCoV感染住院患者（中位年齡為47歲；9名女性）中，臨床表現(xiàn)為上呼吸道感染者12例，6人需要補(bǔ)充氧氣；其中，有2名需要重癥監(jiān)護(hù)，沒有死亡。通過PCR在糞便（4/8 [50％]）和血液（1/12 [8％]）中檢測到病毒，但在尿液中未檢測到。5名需要補(bǔ)充氧氣的患者接受了洛匹那韋-利托那韋治療。使用洛匹那韋-利托那韋治療的5例患者中有4例出現(xiàn)惡心、嘔吐和/或腹瀉，而3例出現(xiàn)肝功能異常檢查結(jié)果?？偠灾?，在新加坡首批被診斷為2019-nCoV感染的18例患者中，臨床表現(xiàn)通常是輕度呼吸道感染。一些患者需要補(bǔ)充氧氣，并在接受抗逆轉(zhuǎn)錄病毒藥物治療后有不同的臨床結(jié)果[4]。

■3月3日，華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)院，金銀潭醫(yī)院等多單位合作在預(yù)印版平臺medRxiv在線發(fā)表未經(jīng)同行評審的題為“Highly ACE2 Expression in Pancreas May Cause Pancreas Damage After SARS-CoV-2 Infection”的研究論文，該研究發(fā)現(xiàn)ACE2在胰腺（外分泌腺和胰島中）中表達(dá)和分布。而且，包括輕度和重度COVID-19患者在內(nèi)的臨床數(shù)據(jù)表明存在輕度胰腺炎。67例重癥患者中，有11例(16.41%)出現(xiàn)淀粉酶和脂肪酶水平升高，5例(7.46%)出現(xiàn)影像學(xué)改變。只有1例(1.85%)顯示淀粉酶和脂肪酶水平升高，但未見影像學(xué)改變?？偠灾?，該研究揭示了COVID-19患者輕度胰腺損傷的現(xiàn)象和可能的原因，這表明2019-nCoV感染后的胰腺炎也應(yīng)在臨床工作中予以重視[5]。

參考文獻(xiàn)：

[1] Tang X, Wu C, Li X, et al. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. National Science Review 2020.

[2] Wu A, Niu P, Wang L, et al. Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV. bioRxiv 2020:2020.02.29.971101.

[3] Ong SWX, Tan YK, Chia PY, et al. Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient. JAMA 2020.

[4] Young BE, Ong SWX, Kalimuddin S, et al. Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA 2020.

[5] Liu F, Long X, Zou W, et al. Highly ACE2 Expression in Pancreas May Cause Pancreas Damage After SARS-CoV-2 Infection. medRxiv 2020:2020.02.28.20029181.

供稿 | 坪山生物醫(yī)藥研發(fā)轉(zhuǎn)化中心、科研部

編輯 | 鮑 啦