1.  COVID-19疫情快訊

■據(jù)韓媒報道，截至當(dāng)?shù)貢r間2月23日下午，韓國新增46例新冠肺炎確診病例，確診總病例數(shù)增至602例。此外，韓國國內(nèi)新冠肺炎確診病例中，已有5人死亡。當(dāng)天稍早些時候，韓國總統(tǒng)文在寅宣布，將新冠肺炎疫情預(yù)警級別上調(diào)至最高級別。這是韓國政府繼2009年甲型H1N1流感后時隔11年再次發(fā)布最高級別的傳染病預(yù)警。

■2月23日，中國科學(xué)院院士、中科院上海藥物所研究員陳凱先接受解放日報記者專訪。對于中醫(yī)藥為何在這次疫情中有明顯的臨床效果的問題，陳凱先院士表示：新冠肺炎是一種新的疾病，由新型冠狀病毒引起，在病理學(xué)、病原學(xué)、流行病學(xué)上表現(xiàn)出一系列新的特點，這給醫(yī)生和科研人員的診斷、治療帶來了很大挑戰(zhàn)。我們還沒有針對新冠肺炎的特效藥，特效藥的研發(fā)所需時間是比較漫長的，目前患者接受的主要是支持性、針對癥狀的療法，醫(yī)生也根據(jù)情況用一些抗病毒和抗感染的藥物。

面對這次疫情，中醫(yī)藥已經(jīng)證明可以發(fā)揮重要作用。新冠肺炎在中醫(yī)理論中屬于溫病時疫，這是感受“外邪”所引起的一類外感急性熱病的總稱。幾千年來，中醫(yī)藥專家提出了許多有關(guān)溫病的理論，積累了豐富的臨床實踐經(jīng)驗，所用方劑和成藥有兩方面功效：一是全身性的調(diào)理作用，增強患者對疾病的抵抗能力，緩解臟器功能損傷，讓患者以較快速度恢復(fù)健康。二是一些治療溫病的中藥含有清熱解毒成分，本身對病毒也有一定抑制作用。當(dāng)然，這方面還有待深入研究。

從這次疫情的臨床實踐來看，全國各地醫(yī)療界廣泛采取了中西醫(yī)結(jié)合方法，取得了很好的臨床效果。在上海，市公共衛(wèi)生臨床中心的中醫(yī)藥救治普及率超過90%，使病人的治愈出院時間平均提前了約2—3天。在武漢，有些醫(yī)院還采用純中醫(yī)治療方法，效果也很好，至今沒有一例病人死亡。正因如此，中央要求不斷優(yōu)化診療方案，堅持中西醫(yī)結(jié)合、中西醫(yī)并重。在最新發(fā)布的《新冠肺炎診療方案（試行第六版）》中，中醫(yī)藥內(nèi)容占了相當(dāng)比重。

■2月22日，浙江省新型冠狀病毒肺炎疫情防控工作第27場新聞發(fā)布會上，浙江省科技廳副廳長宋志恒宣布，第一批疫苗已經(jīng)產(chǎn)生抗體，并進入動物實驗階段，重組腺病毒載體疫苗，開始進行重組病毒的培養(yǎng)，將于近期開展動物實驗。據(jù)悉，浙江省對新冠病毒的篩選已經(jīng)到了第四代，目前科研人員正在爭分奪秒、攻克難題。不過，宋志恒也提醒，要清醒地認(rèn)識到，疫苗研發(fā)的周期比較長，必須尊重科學(xué)規(guī)律，經(jīng)過科學(xué)、嚴(yán)謹(jǐn)、安全的研究過程。

■2月22日，世界衛(wèi)生組織總干事譚德塞通過視頻連線參加在非洲聯(lián)盟總部舉行的緊急會議時表示，為防止新冠病毒在衛(wèi)生系統(tǒng)較弱的國家傳播，世衛(wèi)組織會和非洲國家一道，為可能出現(xiàn)的疫情做好準(zhǔn)備。譚德塞介紹，世衛(wèi)組織已任命2名特使，專為非洲新冠肺炎疫情防控提供戰(zhàn)略咨詢；還根據(jù)與中國人員往來等情況，在非洲確定了13個優(yōu)先防控國家。資金方面，世衛(wèi)組織已啟動“戰(zhàn)略準(zhǔn)備和應(yīng)對方案”，呼吁募集6.75億美元，重點支持新冠肺炎疫情防控風(fēng)險較高的國家。他還介紹說，越來越多非洲國家已能使用世衛(wèi)組織提供的實驗室檢測試劑盒進行新冠病毒檢測；數(shù)以萬計個人防護設(shè)備正分批次運往非洲各地；過去一個月中，約有1.1萬名非洲衛(wèi)生人員接受了世衛(wèi)組織關(guān)于新冠肺炎疫情的在線課程培訓(xùn)。譚德塞說，遏制新冠病毒傳播的“機會窗口”正在收窄，各國應(yīng)盡快做好應(yīng)對準(zhǔn)備，防止疫情蔓延?！拔冶ＷC，世衛(wèi)組織會和所有非洲國家一道，盡我們所能防止病毒傳播，盡早發(fā)現(xiàn)和治療感染病例。”

■2月20日，中國科學(xué)院微生物研究所齊建勛研究員課題組解析了新冠病毒的S蛋白RBD與人細胞受體ACE2蛋白復(fù)合體2.5埃分辨率晶體結(jié)構(gòu)，揭示了S蛋白如何與受體ACE2在原子層面相互作業(yè)。同時，研究人員第一時間將數(shù)據(jù)上傳至國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心（編號：NMDCS0000001），與全世界科學(xué)家共享研究成果，以希望盡快聯(lián)合攻克病毒疫情。

2. COVID-19的生物學(xué)研究進展

■瑞士伯爾尼大學(xué)的Jorerg Jores和Volker Thiel團隊在生物預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv上，提出了基于反向遺傳學(xué)的病毒構(gòu)造策略：無需從病人樣本中提取完整病毒，而可以使用酵母生產(chǎn)出有活性的新冠病毒，或依據(jù)需求改造出實驗所需的病毒工具。需要注意的是，這是一項根據(jù)已知病毒基因組進行病毒重建的基礎(chǔ)研究工作，與“新冠病毒是人工合成的”這樣的謠言不是一回事。研究者們首先依據(jù)病毒核酸RNA序列構(gòu)建出反義的DNA序列。由于整個序列長度大，無法穩(wěn)定地在工具菌當(dāng)中穩(wěn)定復(fù)制，因此，研究者們采取了一種成熟而巧妙的辦法：轉(zhuǎn)化偶聯(lián)重組技術(shù)。研究者將反義DNA拆解成12個長0.5-3.4kbp具有重疊末端序列的DNA片段，并引入GFP（綠色熒光蛋白序列），利用釀酒酵母中的同源重組系統(tǒng)，使得反義DNA在酵母菌中重組成完整的基因序列。之后，在體外，用T7 RNA聚合酶將反義DNA轉(zhuǎn)錄成為有感染性的病毒RNA。通過電穿孔將RNA導(dǎo)入后，發(fā)現(xiàn)正常的VeroE6細胞能夠被感染并發(fā)出熒光。本研究提出的2019-nCoV全合成技術(shù)，能在一周之內(nèi)生產(chǎn)或改造出大量病毒活體，供醫(yī)療和研究機構(gòu)使用，以突破病毒來源的限制。未來，新冠病毒可能會發(fā)生諸多變異，而人工合成將是了解和預(yù)測病毒特征發(fā)展趨勢的重要手段[1]。

3. COVID-19的流行病學(xué)研究

■法國衛(wèi)生與醫(yī)學(xué)研究所的研究主任維多利亞·科里薩(Vittoria Colizza)團隊在The Lancet上發(fā)表了題為“Preparedness and vulnerability of African countries against importations of COVID-19: a modelling study”的研究，評估了病毒輸入非洲的風(fēng)險以及非洲各國檢測和處理病毒的能力。結(jié)果表明，由于埃及、阿爾及利亞和南非共和國與中國具有高度貿(mào)易往來，所以是最有可能傳播病毒的非洲國家。另一方面，這些國家的SPAR（締約國自我評估年度報告）和IDVI評分（傳染病脆弱性指數(shù)）在非洲大陸上名列前茅，可以有效地檢測和遏制該病毒的傳播(SPAR指每個國家每年必須向世界衛(wèi)生組織報告其應(yīng)對疫情的資源，它包括24個項目，總得分在0到100分之間，100分表示對流行病有很強的準(zhǔn)備，反之則準(zhǔn)備能力不足；IDVI分?jǐn)?shù)記為滿分100分，其中0分對應(yīng)于極端脆弱，100分對應(yīng)于最低脆弱)。而尼日利亞、埃塞俄比亞、蘇丹、安哥拉、坦桑尼亞、加納和肯尼亞等其他國家的病毒輸入風(fēng)險較低，但其SPAR和IDVI評分較低，這引發(fā)了人們對可能的輸入病例由于無法被檢測到，而使得病毒在本地甚至全國范圍內(nèi)傳播的擔(dān)憂。該研究結(jié)果有助于告知在被發(fā)現(xiàn)有中度至高危險輸入COVID-19和管理衛(wèi)生緊急情況能力相對較低的特定非洲國家，加強對防備和應(yīng)對疫情[2]。

■2月22日的《LANCET RESPIRATORY MEDICINE》上，華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院和武漢金銀潭醫(yī)院團隊共同發(fā)文，總結(jié)了疫情早期，金銀潭醫(yī)院收治的52例危重癥患者的情況。數(shù)據(jù)顯示，截至2月9日，這52名患者中有32名已去世，收入ICU后的28天病死率，仍然達到61.5%，而且不少患者出現(xiàn)了心臟、肝、腎等器官的損傷。這次金銀潭醫(yī)院52名患者的入院時間，是從去年12月24日到今年的1月26日，占到同期醫(yī)院新冠肺炎患者的約7%（51/710），患者都是武漢本地居民。這些患者當(dāng)中，有17名患者去過華南海鮮市場，另外還有10名患者接觸過其他確診或高度疑似的新冠肺炎患者。從整體特征來看，患者仍然是以中老年為主，男性占到三分之二，合并有心血管疾病、糖尿病等基礎(chǔ)疾病的患者約占四成。從癥狀最早出現(xiàn)，到影像學(xué)檢查確認(rèn)患者雙肺炎癥的中位時間是5天，收入到ICU的中位時間則是9天。在轉(zhuǎn)入ICU時，多數(shù)患者都已經(jīng)出現(xiàn)了器官損傷的表現(xiàn)，三分之二的患者有急性呼吸窘迫綜合征（ARDS），此外還分別有15、15和12名患者出現(xiàn)了急性腎損傷、肝功能異常和心肌損傷?？傊?，2019-nCoV肺炎重癥患者的死亡率是較高的。非幸存者的生存時間可能在ICU入院后1-2周內(nèi)。老年患者(>65歲)且有基礎(chǔ)疾病和ARDS的死亡風(fēng)險增加[3]。

4. 新型冠狀病毒信息庫 

■來自中國生物信息中心等單位的研究團隊在《遺傳》雜志發(fā)表了題為“2019新型冠狀病毒信息庫”的文章：為促進2019-nCoV數(shù)據(jù)共享應(yīng)用并及時向全球公眾提供病毒的相關(guān)信息，國家生物信息中心（CNCB）/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心（NGDC）建立了2019新型冠狀病毒信息庫（2019nCoVR，https://bigd.big.ac.cn/ncov）。該庫整合了來自德國全球流感病毒數(shù)據(jù)庫、美國國家生物技術(shù)信息中心、深圳（國家）基因庫、國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心及CNCB/NGDC等機構(gòu)公開發(fā)布的2019-nCoV核苷酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)、元信息、學(xué)術(shù)文獻、新聞動態(tài)、科普文章等信息，開展了不同冠狀病毒株的基因組序列變異分析并提供可視化展示。同時，2019nCoVR無縫對接CNCB/NGDC的相關(guān)數(shù)據(jù)庫，提供新測序病毒株系的基因組原始測序數(shù)據(jù)、組裝后序列的在線匯交、管理與共享，國際數(shù)據(jù)庫同步發(fā)布等數(shù)據(jù)服務(wù)。而該文章對2019nCoVR的數(shù)據(jù)匯交、管理、發(fā)布及使用等情況進行了全面闡述，以方便用戶了解該庫各項功能及數(shù)據(jù)狀況，為加速開展病毒的分類溯源、變異演化、快速檢測、藥物研發(fā)以及新型肺炎的精準(zhǔn)預(yù)防與治療等研究提供了重要基礎(chǔ)[4]。

參考文獻：

[1] Thao TTN, Labroussaa F, Ebert N, et al. Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform. bioRxiv 2020:2020.02.21.959817.

[2] Gilbert M, Pullano G, Pinotti F, et al. Preparedness and vulnerability of African countries against importations of COVID-19: a modelling study. The Lancet.
[3] Yang X, Yu Y, Xu J, Shu H, et al.Clinical course and outcomes of critically ill patients with SARS-CoV-2 pneumonia in Wuhan, China: a single-centered, retrospective, observational study. Lancet Respir Med 2020.
[4] 趙文明, 宋述慧, 陳梅麗, 等. 2019新型冠狀病毒信息庫[J]. 遺傳.

供稿 | 坪山生物醫(yī)藥研發(fā)轉(zhuǎn)化中心、科研部

編輯 | 鮑 啦